126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4874 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  100 
 
 		 1049 aa  2106    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  70.39 
 
 		 726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  68.71 
 
 		 1148 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.48 
 
 		 801 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  65.52 
 
 		 748 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  35.65 
 
 		 951 aa  180  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  38.2 
 
 		 1011 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  35.21 
 
 		 965 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  34.29 
 
 		 839 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  30.67 
 
 		 791 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  29.55 
 
 		 788 aa  134  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  31.32 
 
 		 648 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  27.53 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  26.21 
 
 		 722 aa  97.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  24.61 
 
 		 832 aa  95.1  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  27.22 
 
 		 2286 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1121 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  28.4 
 
 		 580 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  24.66 
 
 		 838 aa  78.2  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 1013 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.85 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.33 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  28.42 
 
 		 563 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  35.43 
 
 		 1392 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 672 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.3 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 401 aa  63.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 493 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.09 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.25 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  34.11 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0527  hypothetical protein  28.46 
 
 		 480 aa  61.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0252239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  35.16 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  28.72 
 
 		 806 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  31.4 
 
 		 1567 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  29.44 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 1577 aa  58.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.12 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.12 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.12 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  26.19 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.35 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.35 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.43 
 
 		 1139 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.71 
 
 		 520 aa  56.2  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.86 
 
 		 491 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  27.07 
 
 		 172 aa  56.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  24.56 
 
 		 677 aa  55.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.2 
 
 		 794 aa  55.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  34.19 
 
 		 723 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.21 
 
 		 474 aa  54.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.58 
 
 		 495 aa  54.3  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 691 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.66 
 
 		 957 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.81 
 
 		 884 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.37 
 
 		 507 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.17 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 507 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 566 aa  52.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  31.78 
 
 		 1222 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.08 
 
 		 618 aa  52.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  40.17 
 
 		 890 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 858 aa  51.6  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 483 aa  51.6  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  29.37 
 
 		 805 aa  51.6  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  29.37 
 
 		 858 aa  51.6  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  38.2 
 
 		 497 aa  51.6  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 560 aa  51.6  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 807 aa  51.6  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  29.37 
 
 		 800 aa  51.6  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  29.37 
 
 		 800 aa  51.6  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.69 
 
 		 737 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  28.26 
 
 		 1100 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 615 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30 
 
 		 482 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.5 
 
 		 863 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 		 858 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  24.1 
 
 		 752 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.27 
 
 		 2073 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30.95 
 
 		 633 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  33.65 
 
 		 312 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.2 
 
 		 507 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.29 
 
 		 943 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  32.65 
 
 		 665 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  29.2 
 
 		 412 aa  49.3  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.75 
 
 		 507 aa  49.3  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  30.65 
 
 		 373 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.4 
 
 		 695 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1201 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.41 
 
 		 644 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  33.04 
 
 		 574 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.13 
 
 		 489 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 472 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  31.5 
 
 		 503 aa  47.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 239 aa  47.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  40 
 
 		 711 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  23.53 
 
 		 1413 aa  47.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  31.72 
 
 		 425 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>