More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3700 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  64.31 
 
 		 544 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 560 aa  1122    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  61.57 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  58.23 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  61.22 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  60.47 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  55.32 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  55.45 
 
 		 540 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  56.28 
 
 		 580 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  53.36 
 
 		 533 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.51 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  55.82 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.25 
 
 		 538 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  55.84 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  54.58 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.88 
 
 		 566 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  55.47 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.72 
 
 		 550 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.39 
 
 		 545 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  55.8 
 
 		 561 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  54.5 
 
 		 554 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.9 
 
 		 555 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  53.43 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 		 571 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  52.35 
 
 		 543 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  54.41 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.05 
 
 		 563 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.87 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  53.25 
 
 		 565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  53.94 
 
 		 548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.49 
 
 		 532 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  50.27 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.85 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.56 
 
 		 524 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  46.99 
 
 		 605 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.72 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  49.47 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  50.72 
 
 		 576 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  49.41 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  50.65 
 
 		 587 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.48 
 
 		 609 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  45.98 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  49.05 
 
 		 599 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  54.81 
 
 		 594 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  47.74 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  45.91 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  53.03 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  48.8 
 
 		 546 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  45.81 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.29 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  49.63 
 
 		 539 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  47.06 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  47.43 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.55 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.57 
 
 		 604 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  42.4 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  51.87 
 
 		 634 aa  435  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 		 560 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.69 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.81 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.26 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 532 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 536 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 540 aa  335  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.7 
 
 		 539 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.55 
 
 		 515 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.95 
 
 		 535 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.53 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.3 
 
 		 549 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.18 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.3 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  39.47 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  40.4 
 
 		 518 aa  319  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36.46 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.34 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.64 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.29 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 548 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.72 
 
 		 555 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 547 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  36.08 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  38.85 
 
 		 537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  38.01 
 
 		 536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.73 
 
 		 543 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  38.95 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  39.09 
 
 		 537 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.07 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.68 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  38.36 
 
 		 540 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.04 
 
 		 735 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 535 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>