More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1585 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 
517 aa  1060  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 
537 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 
525 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  43.82 
 
 
510 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  44.04 
 
 
694 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 
704 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  42.11 
 
 
670 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.52 
 
 
669 aa  357  4e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 
673 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.77 
 
 
641 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.27 
 
 
620 aa  245  1e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.61 
 
 
630 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.75 
 
 
640 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.27 
 
 
509 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 
631 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
658 aa  202  1e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.08 
 
 
631 aa  196  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.41 
 
 
656 aa  187  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 
638 aa  181  3e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.13 
 
 
673 aa  173  6e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  42.01 
 
 
432 aa  164  5e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.76 
 
 
648 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 
671 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 
427 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 
412 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.11 
 
 
1313 aa  140  5e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  28.87 
 
 
519 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
679 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  23.93 
 
 
712 aa  130  5e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.67 
 
 
626 aa  129  1e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.29 
 
 
677 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.49 
 
 
672 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  28.52 
 
 
504 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  26.88 
 
 
668 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.86 
 
 
903 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  46.88 
 
 
424 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.02 
 
 
665 aa  115  1e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.54 
 
 
660 aa  112  1e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 
241 aa  112  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  1.08242e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.14 
 
 
642 aa  113  1e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 
585 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 
645 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 
361 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  8.15983e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  24.01 
 
 
643 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  24.44 
 
 
650 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  43.7 
 
 
306 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 
586 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.13 
 
 
656 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.9 
 
 
648 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  38.89 
 
 
734 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.44 
 
 
320 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 
613 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 
193 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  26.9 
 
 
666 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
360 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.76 
 
 
224 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.06819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  23.6 
 
 
653 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.02 
 
 
710 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  41.23 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
388 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.05838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.67 
 
 
239 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
449 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 
637 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 
445 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.71 
 
 
707 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
543 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 
537 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  46.36 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
729 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
374 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
459 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
544 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.23 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  24.31 
 
 
757 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  44.23 
 
 
233 aa  91.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  48.96 
 
 
399 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  36.52 
 
 
533 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 
594 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  1.3848e-07  decreased coverage  2.0207e-11 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 
417 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
231 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.59 
 
 
230 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.19 
 
 
407 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
506 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
487 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.57 
 
 
218 aa  90.1  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.07 
 
 
261 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
244 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.07 
 
 
261 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  36.52 
 
 
533 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  37.17 
 
 
1793 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.72 
 
 
464 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 
296 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  43.81 
 
 
463 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
498 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
510 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.14 
 
 
240 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
189 aa  88.6  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  6.7511e-10  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>