More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3326 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  80.33 
 
 		 604 aa  958    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 607 aa  1217    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  50.59 
 
 		 630 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 592 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.27 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 1450 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 688 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 		 747 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 747 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 740 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 556 aa  220  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 3145 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  40.37 
 
 		 360 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1827 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 714 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1005 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 		 626 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  38.64 
 
 		 473 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.42 
 
 		 714 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.7 
 
 		 1077 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 595 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 		 1034 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 689 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 935 aa  203  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 529 aa  204  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 626 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 		 648 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 614 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  37.85 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.26 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  38.92 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.96 
 
 		 653 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 653 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.51 
 
 		 1764 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 612 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 636 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.68 
 
 		 600 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 611 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 637 aa  193  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 		 496 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1454 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1451 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.73 
 
 		 550 aa  191  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 649 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 611 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 649 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 620 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 571 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 635 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 635 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 646 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  35.22 
 
 		 385 aa  187  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 955 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.4 
 
 		 760 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 593 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 545 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 681 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.98 
 
 		 546 aa  180  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.21 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.23 
 
 		 872 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 637 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 		 1073 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 615 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1038 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 546 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.66 
 
 		 503 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 636 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.44 
 
 		 1677 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7048  hypothetical protein  31.76 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0796926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 536 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.03 
 
 		 603 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>