More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6068 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1060    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  57.03 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  38.93 
 
 		 1764 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 574 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.68 
 
 		 577 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 955 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 1827 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.71 
 
 		 1077 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 608 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.9 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 		 648 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 3145 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 602 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 740 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 747 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 935 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.17 
 
 		 1034 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1450 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 688 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 646 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 649 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 649 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 1038 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 1005 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.2 
 
 		 703 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.94 
 
 		 1677 aa  211  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 714 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 653 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.2 
 
 		 760 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.86 
 
 		 653 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.73 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 662 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.67 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 637 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 767 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 780 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 		 689 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 		 714 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.95 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 636 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.91 
 
 		 615 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 681 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 614 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  40.72 
 
 		 747 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 639 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 		 626 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.71 
 
 		 502 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 502 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 		 626 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.35 
 
 		 546 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 636 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 611 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.99 
 
 		 387 aa  190  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.88 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.51 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 612 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 1212 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 607 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 1454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 705 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 559 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.23 
 
 		 872 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.22 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.39 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  36.1 
 
 		 385 aa  170  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  32.96 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>