166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1162 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1303    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  46.94 
 
 		 637 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  40.83 
 
 		 630 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  36.31 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  36.72 
 
 		 657 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  46.22 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  44.66 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  38.34 
 
 		 624 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  41.31 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 3560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  34.24 
 
 		 632 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 4489 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  41.87 
 
 		 1094 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  41.62 
 
 		 1085 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  41.92 
 
 		 492 aa  278  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.64 
 
 		 3035 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  40.73 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 		 618 aa  275  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 654 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  38.87 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.83 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 		 672 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 		 700 aa  250  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  39.84 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  38.42 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 732 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 740 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 750 aa  238  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 667 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 660 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 750 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 611 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 909 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 1106 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.21 
 
 		 816 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 647 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  37.17 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.66 
 
 		 680 aa  217  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  34.89 
 
 		 395 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  37.26 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  36.99 
 
 		 590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 1106 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 1714 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.41 
 
 		 589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.94 
 
 		 585 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 754 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 739 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  33.33 
 
 		 568 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 295 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 754 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 632 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  33.59 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.31 
 
 		 589 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 739 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  28.67 
 
 		 745 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 789 aa  187  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.16 
 
 		 570 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 667 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 828 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 789 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 738 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 968 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 708 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 828 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 828 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  30.99 
 
 		 740 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.73 
 
 		 719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 833 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 833 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 626 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.59 
 
 		 699 aa  170  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.74 
 
 		 739 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.46 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 739 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 717 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 717 aa  164  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.16 
 
 		 797 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  28.64 
 
 		 1116 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.77 
 
 		 552 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 718 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.58 
 
 		 742 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 779 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.12 
 
 		 1221 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  28.32 
 
 		 747 aa  160  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.28 
 
 		 1415 aa  160  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.9 
 
 		 780 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 780 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.55 
 
 		 740 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.98 
 
 		 781 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 734 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>