More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3261 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3261  diguanylate cyclase  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4809  diguanylate cyclase  31.66 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.780327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1761  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3234  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0524  diguanylate cyclase  31.27 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0541  diguanylate cyclase  31.27 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3237  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  31.6 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  37.71 
 
 		 659 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  40.13 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.36 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0138  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1815  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.404044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  34.85 
 
 		 358 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3763  GGDEF  32.74 
 
 		 358 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 471 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  38.22 
 
 		 491 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  34.73 
 
 		 565 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  36.68 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2293  GGDEF  33.15 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00190961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  38.24 
 
 		 565 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  34.27 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 380 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  34.08 
 
 		 799 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 580 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.03 
 
 		 610 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 387 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 381 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 378 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0249  hypothetical protein  40.12 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.57 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02110  GGDEF domain-containing protein  40.12 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.594222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4011  diguanylate cyclase  34.74 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0413  diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679867 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0214  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3236  hypothetical protein  36.7 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0104131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3412  hypothetical protein  36.7 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0269335  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0664  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.78 
 
 		 711 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 591 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 495 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 477 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  34.39 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.67 
 
 		 772 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1595  response regulator receiver domain-containing protein  38.82 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 611 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.82 
 
 		 800 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 467 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.84 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.8 
 
 		 754 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  36.08 
 
 		 451 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.5 
 
 		 730 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.43603  normal  0.0272546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.82 
 
 		 796 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.88 
 
 		 794 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  37.78 
 
 		 563 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  35.22 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 227 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1622  sensory box protein  32.54 
 
 		 1075 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.43 
 
 		 1000 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4937  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 980 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.157609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 738 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 620 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 492 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  37.01 
 
 		 531 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.52 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3861  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 980 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.861278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 172 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  35 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  33.04 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 569 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.42 
 
 		 698 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3924  sensory box protein  34.92 
 
 		 1086 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  36.69 
 
 		 808 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.73 
 
 		 980 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.58 
 
 		 971 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.57 
 
 		 890 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.19 
 
 		 836 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  34.19 
 
 		 792 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 432 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 		 706 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0817  diguanylate cyclase  42.55 
 
 		 560 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  39.1 
 
 		 569 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  36.31 
 
 		 568 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1609  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.24 
 
 		 796 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>