More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4587 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4587  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 410 aa  840    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627226  normal  0.707851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.31 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.44 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.08 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.18 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.77 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.28 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.57 
 
 		 432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.48 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.51 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.34 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.47 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  29.87 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  34.96 
 
 		 461 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.39 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.33 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  34.23 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.73 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.46 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.72 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.72 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.96 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  29.32 
 
 		 433 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  29.32 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  34.31 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  27.99 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  25.73 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  29.74 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.96 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.88 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.25 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  30.11 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.4 
 
 		 450 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  30.79 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.76 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.1 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.77 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  31.77 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  30.96 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  28.1 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  27.99 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.45 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  27.6 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  30.13 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.12 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  30.54 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  28.87 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  32.93 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30.13 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  28.61 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.9 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.86 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.79 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.69 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  31.16 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  31.16 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  28.52 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  28.52 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  28.52 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  29.85 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  32.05 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30.03 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  28.76 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.42 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>