More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1268 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 263 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 263 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.1 
 
 		 263 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 		 295 aa  316  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.68 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.83 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.15 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.17 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.74 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.44 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  35.02 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.64 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.88 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  36.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  32.32 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 		 590 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.75 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.3 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 568 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  26.3 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  30.86 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.92 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3838  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0844914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 596 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>