More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2398 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.56 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.19 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.19 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.08 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.23 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.84 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.07 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.27 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.29 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.29 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  33.87 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.67 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.88 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  30.51 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.76 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.22 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.56 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>