More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1642 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
295 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.39 
 
 
269 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 
263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 
266 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 
270 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
256 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  47.21 
 
 
270 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
263 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
264 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
258 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
269 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
266 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
269 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.45 
 
 
264 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.4 
 
 
264 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
264 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
265 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
272 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.4 
 
 
263 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
263 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
318 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
258 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
267 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
258 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
266 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
271 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
252 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
273 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.54 
 
 
252 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.32 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  30.13 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.29 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.33 
 
 
252 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
275 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
247 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2616  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
250 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
254 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
249 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
253 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.5 
 
 
256 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3838  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
272 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0844914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.83 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
263 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
254 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
244 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
276 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
246 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36 
 
 
249 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2423  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.29 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
254 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
275 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
269 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1807  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.81 
 
 
252 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2419  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.81 
 
 
252 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
247 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  29.62 
 
 
295 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
280 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.65 
 
 
256 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
259 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  27.73 
 
 
276 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
270 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.75 
 
 
258 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  41.71 
 
 
265 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
246 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.42 
 
 
256 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
250 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
245 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.32 
 
 
252 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
285 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 
251 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  31.25 
 
 
300 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  34.95 
 
 
260 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
249 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
277 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
265 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
251 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
266 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.32 
 
 
247 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
256 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
271 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.32 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
253 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>