More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0361 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.13 
 
 		 318 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.61 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  46.07 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50.22 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.3 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.45 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09850  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.98 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.51 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.91 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.34 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.4 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.63 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 602 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  31.25 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 602 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  32.81 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  33.21 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.1 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.34 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34.67 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.51 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  32.1 
 
 		 300 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>