More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 		 263 aa  517  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.61 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.73 
 
 		 272 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.9 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  50.41 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  47.71 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.98 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 295 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.25 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.08 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  39.46 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.18 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  27.23 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.48 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  27.31 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.49 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.81 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>