More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0974 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
253 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.8 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.29 
 
 
251 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
260 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
251 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
248 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 
253 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
282 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
255 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
260 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
250 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
256 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
244 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
252 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.69 
 
 
255 aa  155  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  35.38 
 
 
261 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
258 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
254 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  41 
 
 
267 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
245 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
272 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
261 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
253 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
172 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000011557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
257 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.85 
 
 
272 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
263 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
252 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
251 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0620  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.45 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.8 
 
 
246 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
246 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
256 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
282 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
245 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
282 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
251 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
252 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.4 
 
 
246 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
260 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
253 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
247 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
269 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
254 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352293  normal  0.915226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.47 
 
 
246 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
251 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
262 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
248 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
260 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
261 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
255 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
250 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
263 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
282 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.93 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.77 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
276 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.13 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.25 
 
 
256 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
266 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>