More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4827 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 		 280 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.34 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.29 
 
 		 280 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0692729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0620  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.07 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.126058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  41.58 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0816082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  41.47 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 267 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 256 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 246 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00507131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3470  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.698077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.23 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 247 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  37.21 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159524  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.69 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 239 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 243 aa  153  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 		 252 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  37.98 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  37.93 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.98 
 
 		 247 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.96 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  38.46 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.82 
 
 		 247 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>