More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2896 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  553  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.98 
 
 
279 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.98 
 
 
279 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.93 
 
 
279 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.57 
 
 
277 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
278 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
278 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.43 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.43 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 
279 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
279 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.75 
 
 
273 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
278 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.74 
 
 
278 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.62 
 
 
268 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
268 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 
267 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 
266 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
271 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
273 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
273 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.53 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 
265 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.05 
 
 
276 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.05 
 
 
276 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.05 
 
 
276 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
271 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
268 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.57 
 
 
272 aa  225  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
273 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.7 
 
 
272 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.48 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 
276 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  44.01 
 
 
276 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  45.07 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
272 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
282 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.98 
 
 
271 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
286 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.31 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
271 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
272 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
275 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
292 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 
292 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 
292 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
292 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
285 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
286 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
278 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
274 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
267 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
272 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
286 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
286 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
286 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
276 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
284 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
261 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
268 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 
246 aa  158  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
250 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
270 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
250 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.69 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 
247 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
257 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
248 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>