More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2588 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.66 
 
 
292 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.66 
 
 
292 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.12 
 
 
292 aa  557  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
282 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
286 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
286 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
286 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
286 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
286 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
286 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 
277 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
284 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
278 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
278 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
278 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
279 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
278 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 
278 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.69 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.72 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
271 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
279 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
279 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.77 
 
 
272 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
268 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
282 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
280 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
271 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.49 
 
 
272 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.96 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.96 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.96 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
273 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
272 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
272 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
273 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
268 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
279 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 
273 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
276 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
276 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.91 
 
 
272 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
276 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 
276 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 
276 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
271 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
267 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
268 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
273 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
274 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
267 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
271 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
272 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 
275 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
265 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
273 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.91 
 
 
285 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.47 
 
 
285 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
284 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
284 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
284 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
267 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.09 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
272 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
272 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
248 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
248 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
285 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
248 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4201  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.8 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.622322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 
272 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 
272 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.36 
 
 
258 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.87 
 
 
248 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.83 
 
 
298 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>