More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1905 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.83 
 
 
268 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.32 
 
 
269 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.32 
 
 
269 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.32 
 
 
269 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 
268 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.44 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
279 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
279 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
279 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
279 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
278 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
279 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
279 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
271 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.52 
 
 
284 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.3 
 
 
273 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
271 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  47.99 
 
 
276 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
278 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
276 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
276 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
276 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.53 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.53 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.12 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 
276 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
272 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
279 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
271 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
266 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
265 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.13 
 
 
272 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
274 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
273 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
273 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 
276 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 
276 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 
276 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
273 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
273 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
284 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.19 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
273 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.45 
 
 
279 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.45 
 
 
279 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
285 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
276 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.58 
 
 
285 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
286 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
273 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.64 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.64 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.64 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.59 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
292 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
292 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
292 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
286 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
292 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
286 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
286 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
272 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
278 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
272 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
272 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
250 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
251 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.07 
 
 
246 aa  141  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.84 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.87 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  37.97 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
244 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
244 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
268 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>