More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0322 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.98 
 
 
279 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.18 
 
 
279 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
277 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.64 
 
 
278 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.27 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.27 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 
278 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.32 
 
 
278 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.88 
 
 
279 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
284 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
273 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
278 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
278 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
273 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
267 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
266 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
268 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
268 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
265 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
280 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
271 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
273 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
271 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
268 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
273 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
269 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
269 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
269 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.39 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.06 
 
 
272 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  43.86 
 
 
276 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.64 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.64 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.64 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.45 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
276 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  45.61 
 
 
276 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
276 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
276 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.12 
 
 
285 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.26 
 
 
272 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
271 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.39 
 
 
285 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.55 
 
 
284 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.55 
 
 
284 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.55 
 
 
284 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.86 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
272 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
292 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
292 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
292 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
292 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
278 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
282 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
272 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
274 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
282 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
273 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
286 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
270 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
268 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
286 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
272 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
272 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
269 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.93 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.19 
 
 
246 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 
269 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.31 
 
 
244 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
256 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
244 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.63 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>