More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2006 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.48 
 
 
292 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
292 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 
292 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 
292 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.32 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
286 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
286 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
286 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
286 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
286 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
278 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
278 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 
278 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
278 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
278 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.45 
 
 
277 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
284 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
279 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
279 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
279 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
279 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
273 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
273 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
279 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
278 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
271 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
278 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.57 
 
 
272 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
282 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
268 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.84 
 
 
276 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
280 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.84 
 
 
276 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.84 
 
 
276 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
273 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
271 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.67 
 
 
272 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
267 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 
276 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
276 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
269 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
269 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
276 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
269 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
276 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
276 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.88 
 
 
275 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
278 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 
273 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
268 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.44 
 
 
272 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.55 
 
 
265 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
271 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
268 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.59 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
279 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
273 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
279 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.02 
 
 
284 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.02 
 
 
284 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.02 
 
 
284 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
273 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
272 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
267 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
272 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
274 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
270 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
268 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
272 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
273 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
272 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  34.3 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.87 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>