More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4476 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
273 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.68 
 
 
277 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
279 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 
284 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
278 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
278 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
279 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
278 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
279 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
278 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
279 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
278 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
278 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
268 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
280 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
268 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
271 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  44.29 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.91 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.91 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.91 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.26 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.77 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.6 
 
 
285 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
271 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
267 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
267 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
266 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
273 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
276 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
276 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
276 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
285 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
276 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
273 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
272 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.19 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.19 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.19 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
268 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
274 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
272 aa  191  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
268 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
269 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
269 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
269 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
282 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
273 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
267 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
274 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
273 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
286 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
292 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
284 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
292 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
292 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
292 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
272 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
286 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
282 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
270 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
286 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
286 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
286 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
286 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
280 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
263 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
263 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
263 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
263 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
263 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
253 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 
246 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
252 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
270 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>