More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3258 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.03 
 
 
271 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.82 
 
 
272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
277 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.73 
 
 
272 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.85 
 
 
272 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.99 
 
 
276 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.99 
 
 
276 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.99 
 
 
276 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 
271 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
273 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
273 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.16 
 
 
273 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.22 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
273 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
276 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
278 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
278 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
278 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
278 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.89 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 
273 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
278 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 
276 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
279 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
279 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
279 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 
284 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
268 aa  251  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
278 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
278 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
276 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.53 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
279 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 
272 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
268 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
273 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
273 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
280 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
267 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
279 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
279 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
274 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
272 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.53 
 
 
275 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.81 
 
 
285 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.46 
 
 
285 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
292 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.14 
 
 
284 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
286 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
286 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
267 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
266 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
282 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
270 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
272 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
284 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
265 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
274 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 
267 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
273 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
268 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
247 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.19 
 
 
246 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.81 
 
 
246 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
253 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.96 
 
 
246 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
267 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.46 
 
 
245 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.42 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.84 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
248 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 
244 aa  132  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  33.95 
 
 
286 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>