More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1918 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.63 
 
 
273 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.25 
 
 
273 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.04 
 
 
271 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
271 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
273 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.92 
 
 
272 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
271 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
278 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
284 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
278 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
278 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
278 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.43 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
277 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.73 
 
 
272 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
279 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
268 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  50.37 
 
 
276 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
278 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
279 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 
276 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
268 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
279 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 
276 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
282 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
278 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
279 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
278 aa  234  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
279 aa  234  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.36 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.36 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.36 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
280 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
273 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.13 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
282 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
276 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.46 
 
 
284 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.46 
 
 
284 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.46 
 
 
284 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
273 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
279 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
279 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
268 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.35 
 
 
285 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.73 
 
 
275 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
292 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
292 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
292 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
265 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
267 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
266 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
272 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
273 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
286 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
272 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
286 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
286 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
286 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
286 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
272 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
270 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
284 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
249 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
253 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.19 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
258 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
247 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
256 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>