More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4489 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.06 
 
 
277 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
284 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.27 
 
 
278 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
278 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.99 
 
 
278 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.99 
 
 
278 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
278 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
279 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
279 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
279 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
278 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.27 
 
 
278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.07 
 
 
279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.93 
 
 
279 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.04 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.18 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.18 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
280 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
273 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.35 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.88 
 
 
273 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 
265 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 
267 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
266 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  50.89 
 
 
276 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
268 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
273 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.96 
 
 
276 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.96 
 
 
276 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.96 
 
 
276 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 
276 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
273 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
273 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  50.53 
 
 
276 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
268 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.62 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.23 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.35 
 
 
272 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
273 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
267 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
269 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
269 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
269 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.75 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
292 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 
272 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 
272 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
284 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
292 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
292 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
272 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
274 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
292 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
286 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
282 aa  224  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 
278 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
271 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.2 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
286 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.13 
 
 
285 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.88 
 
 
285 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
273 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
276 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
267 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
274 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
272 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
268 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
270 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
252 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
246 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.53 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.82 
 
 
248 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.53 
 
 
246 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.77 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
246 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
246 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>