More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3394 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  88.77 
 
 
276 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  88.41 
 
 
276 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  88.41 
 
 
276 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  82.97 
 
 
276 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
273 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.54 
 
 
276 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.54 
 
 
276 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.54 
 
 
276 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.14 
 
 
272 aa  288  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
277 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.48 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.12 
 
 
272 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.91 
 
 
271 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.18 
 
 
273 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 
268 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
278 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
278 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
278 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
278 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
273 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
278 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
273 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
273 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
279 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
284 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
278 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
279 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
268 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
273 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
279 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
279 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
279 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
268 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
282 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
269 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
269 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
269 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 
286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
273 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
278 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
276 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
279 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
267 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
272 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
272 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
272 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
273 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.91 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.86 
 
 
285 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.18 
 
 
275 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 
272 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.31 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.31 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.31 
 
 
284 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 
271 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
282 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
292 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
279 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
279 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.86 
 
 
286 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
286 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
286 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
286 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
272 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
273 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
270 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
267 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
265 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
274 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
256 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  33.33 
 
 
261 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 
246 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 
246 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
282 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
252 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.42 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>