More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3395 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  533  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.02 
 
 
269 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.02 
 
 
269 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.02 
 
 
269 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.83 
 
 
267 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.81 
 
 
268 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
268 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
279 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
273 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
278 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
278 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
279 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
279 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
279 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
279 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
276 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.96 
 
 
284 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
271 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
278 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
276 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
276 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
278 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
278 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
278 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
276 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
279 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
272 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
272 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
272 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
276 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.88 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.99 
 
 
276 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.99 
 
 
276 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.99 
 
 
276 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.64 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
271 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 
273 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.97 
 
 
272 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.99 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 
273 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
284 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
273 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
273 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
273 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.55 
 
 
285 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
267 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
266 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
285 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
280 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.96 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.96 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.96 
 
 
284 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.12 
 
 
275 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
292 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
273 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
292 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 
292 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 
292 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
286 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
282 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
282 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
270 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
278 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
286 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
272 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
286 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
286 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
286 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
273 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
272 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
267 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.21 
 
 
246 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.46 
 
 
246 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.35 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.48 
 
 
248 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
261 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
253 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
268 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
252 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.09 
 
 
248 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>