More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4592 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.32 
 
 
282 aa  314  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.42 
 
 
292 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
286 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
292 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
292 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
292 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
286 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 
286 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 
286 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 
286 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
279 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 
277 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
278 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
278 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.43 
 
 
276 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.43 
 
 
276 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.43 
 
 
276 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
278 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
278 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
284 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
271 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
279 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.71 
 
 
272 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
279 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.43 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
268 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 
282 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  44.48 
 
 
276 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  44.48 
 
 
276 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.57 
 
 
272 aa  205  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 
276 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 
273 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 
273 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
278 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 
273 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
271 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
269 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
269 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
269 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
279 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
278 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
273 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
271 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  43.45 
 
 
276 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
274 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
273 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
268 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
280 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
267 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
267 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
266 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
273 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
271 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
272 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
272 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
272 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
272 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
273 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.21 
 
 
275 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
279 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
279 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.73 
 
 
285 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.68 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.01 
 
 
284 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.01 
 
 
284 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.01 
 
 
284 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
270 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
272 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
272 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
272 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
267 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
261 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
268 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  31.79 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
287 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.67 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
256 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
263 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>