More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1589 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  95.7 
 
 
279 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.04 
 
 
279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.68 
 
 
279 aa  513  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.04 
 
 
279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.42 
 
 
278 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.42 
 
 
278 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.42 
 
 
278 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.06 
 
 
278 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.27 
 
 
278 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.08 
 
 
278 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.08 
 
 
278 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.9 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.07 
 
 
279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.48 
 
 
268 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
279 aa  278  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
284 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
280 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
268 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
271 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
267 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
266 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
273 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
273 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
273 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
279 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
274 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
272 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
271 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.74 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.74 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.74 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
272 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.46 
 
 
272 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
271 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.42 
 
 
285 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  48.42 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.65 
 
 
275 aa  245  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
265 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.55 
 
 
285 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  49.29 
 
 
276 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  49.29 
 
 
276 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.82 
 
 
272 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  49.29 
 
 
276 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.52 
 
 
284 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.52 
 
 
284 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.52 
 
 
284 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.29 
 
 
272 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
273 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
286 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
267 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
269 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
269 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
269 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 
286 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
273 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 
292 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.62 
 
 
270 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
278 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
286 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
286 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
286 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
286 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
272 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
273 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
274 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
267 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
268 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
253 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
263 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
250 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
263 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
263 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
263 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
263 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
263 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
263 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>