More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4448 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  534  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
273 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
277 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.75 
 
 
279 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
278 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.54 
 
 
278 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.54 
 
 
278 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.54 
 
 
278 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
278 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
284 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
279 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
279 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
279 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
278 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.35 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
279 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
279 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
278 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
279 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
279 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
267 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
266 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
280 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
268 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 
268 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
273 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
273 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
273 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
276 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
271 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
273 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
276 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
271 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
273 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.06 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.28 
 
 
276 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.28 
 
 
276 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.28 
 
 
276 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
271 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
272 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
272 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
274 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.73 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.55 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
282 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
267 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
267 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.16 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.16 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.16 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
285 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
269 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
269 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
269 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
278 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
286 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.22 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
268 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
286 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
276 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
282 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
286 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
286 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
286 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
286 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
292 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.161541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
292 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.194779  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
273 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
272 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
256 aa  148  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
261 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
245 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
280 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.94 
 
 
248 aa  140  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
269 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
245 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.4 
 
 
247 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.44 
 
 
246 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
245 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>