More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2447 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.71 
 
 
263 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.15 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.92 
 
 
318 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  48.16 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
256 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
266 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  50 
 
 
270 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
269 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.73 
 
 
264 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
265 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
295 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
266 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
269 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.07 
 
 
263 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.17 
 
 
266 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
263 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
263 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
263 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
264 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 
252 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
256 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
268 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
269 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
250 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
275 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
267 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  40 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  35.45 
 
 
289 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
252 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  34.53 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
250 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.33 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  31.78 
 
 
273 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
278 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
253 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  31.78 
 
 
273 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
258 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
255 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
251 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
274 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  29.83 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  38.36 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
258 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.34 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.82 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.38 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.49 
 
 
249 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
270 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.49 
 
 
249 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
252 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
254 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.32 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>