More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2919 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  66.67 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.29 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.16 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.28 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.87 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.12 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 269 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.21 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.42 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.5 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.19 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.92 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.62 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.82 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.7 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 302 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.96 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1733  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  32.42 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524873  normal  0.240055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.44 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.25 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.19 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>