More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0493 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  77.46 
 
 
245 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.53 
 
 
255 aa  341  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.07 
 
 
248 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.29 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
254 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.66 
 
 
254 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 
261 aa  295  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.66 
 
 
250 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
259 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.04 
 
 
243 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  60 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
252 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
252 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  58.78 
 
 
243 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  58.94 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.6 
 
 
251 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.03 
 
 
251 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.03 
 
 
251 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  55.47 
 
 
266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
262 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  57.03 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
252 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
253 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
253 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
261 aa  231  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  52.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
253 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.42 
 
 
227 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
257 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
254 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
248 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.95 
 
 
248 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  201  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  46 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
250 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
261 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
248 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
254 aa  191  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
248 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
250 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
248 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
257 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
250 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
250 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.91 
 
 
253 aa  185  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.63 
 
 
249 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.63 
 
 
249 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  38.28 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
250 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  42.21 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.41 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  37.89 
 
 
257 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  40 
 
 
248 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
251 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  40.25 
 
 
250 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.22 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
256 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  43.39 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.22 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.22 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.22 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  41.22 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.59 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
252 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
256 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.19 
 
 
258 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
257 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
251 aa  175  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.98 
 
 
249 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
252 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.59 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  39.59 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  39.59 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.59 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.18 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.42 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>