More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3261 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.14 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.96 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  39.78 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.42 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2379  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 		 472 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0955086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.685606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.71 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 		 451 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 		 451 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  decreased coverage  0.0000299289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 453 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0965577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  37.31 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.07 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.97 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  35.08 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02320  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0560932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  35.11 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.1 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  35.08 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  35.03 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 233 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  37.37 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>