More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0465 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
270 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
267 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
260 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
261 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
261 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
261 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.236721  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
249 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
264 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  41.67 
 
 
265 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
277 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
274 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
275 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
274 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
274 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
263 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
251 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
255 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
267 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
285 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 
252 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
255 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
321 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
280 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
249 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  37.97 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 
254 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.85 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.24 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
258 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
280 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.76 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.9 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.19 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.19 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
260 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466231  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
253 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  33.83 
 
 
257 aa  91.7  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
262 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.65 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.02 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.8 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.03 
 
 
261 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  34.59 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
253 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.521278  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.05 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3036  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
252 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0329583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>