More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2275 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
264 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
266 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.31 
 
 
270 aa  274  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
260 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
260 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796111  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  58.37 
 
 
257 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.25 
 
 
255 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.815314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.36 
 
 
257 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02008  oxidoreductase protein  59.76 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2183  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.53 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159949  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.91 
 
 
259 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
254 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
258 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
244 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2681  putative oxidoreductase  53.66 
 
 
253 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0978902  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.36 
 
 
249 aa  218  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128748  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
245 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242279  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
261 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
257 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
257 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
285 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.72 
 
 
257 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 
253 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.361501  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
277 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
261 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
261 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
259 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
258 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
253 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00870136  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
251 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.878077  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
258 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  41.11 
 
 
256 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
256 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
247 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.25 
 
 
258 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.65 
 
 
265 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.32 
 
 
257 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  40.8 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.55845  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
233 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
246 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.65 
 
 
259 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.13 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.13 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
251 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.485878  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
248 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.04 
 
 
245 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.93 
 
 
241 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  38.91 
 
 
246 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
264 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.55 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
245 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
264 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3283  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
253 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
247 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  39.33 
 
 
246 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.32 
 
 
249 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
248 aa  159  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
265 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.8 
 
 
256 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
256 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 
258 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  38.8 
 
 
264 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72880  putative short-chain dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  38.8 
 
 
264 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
249 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00209875  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
245 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
246 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
245 aa  159  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
261 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  39.53 
 
 
248 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
262 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  39.36 
 
 
241 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.98 
 
 
245 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
257 aa  158  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6325  putative short-chain dehydrogenase  43.89 
 
 
260 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
257 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
252 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
261 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
292 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
245 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
292 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.03 
 
 
246 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>