More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5302 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.14 
 
 		 261 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 235 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0560932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.3 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.1 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  41.18 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.1 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.27 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.27 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.27 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.53 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.46 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.46 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.03 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0620  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.81 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  37.43 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.1 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.17 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.33 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.33 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.38 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.56 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  29.56 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>