More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1267 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.14 
 
 
261 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.14 
 
 
261 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.14 
 
 
261 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
274 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
262 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
270 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
267 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 
253 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  42.71 
 
 
265 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
245 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 
255 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
255 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
250 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.55 
 
 
246 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
257 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
255 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.58 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
253 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
256 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0560932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
251 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 
253 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
274 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
254 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.41 
 
 
259 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
262 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
252 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
251 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
263 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 
253 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
274 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
274 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.17 
 
 
248 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
263 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
246 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 
259 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
253 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
256 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
256 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
298 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.15 
 
 
256 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
280 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
265 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 
248 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.86 
 
 
265 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.46 
 
 
248 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
273 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.56 
 
 
246 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
252 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
255 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
245 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
246 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
256 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
264 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
282 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
270 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
264 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
264 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
252 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 
265 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
257 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
257 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
257 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
242 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
257 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
285 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.8 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.82 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
262 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
251 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
285 aa  99  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
277 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.58 
 
 
260 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
309 aa  98.6  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
278 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
254 aa  99  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.27 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>