More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1829 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.53 
 
 
272 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.29 
 
 
258 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  58.41 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
256 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
264 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.47 
 
 
264 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
270 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
263 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
263 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
263 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
266 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
263 aa  185  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.03 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
295 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
318 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
269 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.81 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.21 
 
 
264 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
263 aa  168  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
258 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
267 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
266 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
253 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
253 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  34.43 
 
 
241 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 
273 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
274 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
242 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
242 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  32.76 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  32.42 
 
 
242 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
268 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.85 
 
 
451 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  decreased coverage  0.0000299289 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  32.42 
 
 
242 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
300 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
254 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.76 
 
 
451 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
242 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0412  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 
477 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0813241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
453 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0965577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  32.73 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159524  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  29.15 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
275 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.236721  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.05 
 
 
251 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
269 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  35 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
245 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0240  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
453 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0230  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
453 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.751134  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
261 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
247 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0250  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
453 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  34.56 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.78 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.32 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>