More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2914 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 
258 aa  274  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  57.71 
 
 
263 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
265 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
263 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
318 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.8 
 
 
264 aa  198  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.92 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
295 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
266 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
263 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
266 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.93 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
269 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
263 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
264 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
268 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
267 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
251 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 
273 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
297 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
291 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.89 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  26.4 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.4 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.69 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  26.48 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.64 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.72 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  25.19 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  26.51 
 
 
269 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
259 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
274 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  25.81 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  35.09 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  30.38 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  25.81 
 
 
270 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  30.47 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  29 
 
 
257 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
251 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.27 
 
 
247 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  28.17 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  29 
 
 
257 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>