More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1821 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
269 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  52.51 
 
 
264 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
266 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
263 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
267 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
266 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.66 
 
 
263 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
265 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
263 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
272 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
263 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.21 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
264 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
258 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.77 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
318 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
266 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
295 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
263 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
258 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
264 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
252 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  38.42 
 
 
265 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.85 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.37 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 
244 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000690955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.4 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000227771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
261 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
261 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
261 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  30.13 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  31.93 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.96 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  30.69 
 
 
256 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000411328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
262 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  30.13 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  36.13 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  32.3 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.07 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  32.31 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.73 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01097  hypothetical protein  30.73 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000400605  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.78 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
255 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
266 aa  89  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
242 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
261 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2554  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.3114e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  29.84 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1472  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000346671  hitchhiker  0.00000000000000508287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1214  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2034  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  decreased coverage  0.000000561813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>