More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2335 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  83.73 
 
 
252 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.45 
 
 
252 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  53.63 
 
 
258 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  53.17 
 
 
262 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
253 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.61 
 
 
260 aa  244  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.19 
 
 
261 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.4 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.98 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.99 
 
 
260 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50 
 
 
258 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51 
 
 
256 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.92 
 
 
261 aa  234  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.65 
 
 
261 aa  234  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.89 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.6 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.4 
 
 
251 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.47 
 
 
261 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.47 
 
 
261 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.02 
 
 
256 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.1 
 
 
277 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.49 
 
 
258 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.98 
 
 
261 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.61 
 
 
258 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
257 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.56 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.69 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.92 
 
 
261 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.63 
 
 
277 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
262 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.28 
 
 
258 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
259 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
259 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.01 
 
 
250 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
261 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
261 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.31 
 
 
261 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.66 
 
 
260 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.21 
 
 
261 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
258 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
258 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.28 
 
 
258 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.49 
 
 
258 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
258 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.74 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
258 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  44.92 
 
 
263 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.92 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  44.4 
 
 
257 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.46 
 
 
260 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.77 
 
 
262 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.8 
 
 
249 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.33 
 
 
263 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
258 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.83 
 
 
261 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.33 
 
 
257 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.38 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
262 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.8 
 
 
261 aa  214  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.53 
 
 
258 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.83 
 
 
262 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.1 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.41 
 
 
249 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
252 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0943  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
270 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
255 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.39 
 
 
256 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
258 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.53 
 
 
261 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
250 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45 
 
 
266 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
258 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.7 
 
 
256 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3788  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.11 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.92 
 
 
263 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  44.4 
 
 
260 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0517  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
266 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.46 
 
 
262 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.25 
 
 
256 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
253 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.25 
 
 
256 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2793  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.62 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313223  normal  0.208363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
256 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>