More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3864 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 272 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.82 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16720  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  64.81 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.39 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 		 256 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.69 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.11 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0109588  hitchhiker  0.00528047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3982  putative short-chain dehydrogenase/reductase  48.82 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0102992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.08 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.08 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.09 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.08 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0863327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.97 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.68 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.87 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.718315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561861  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.209869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0544906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  29.84 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 241 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  40.62 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.98 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  34.69 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.17 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 		 595 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.89 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.02 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159524  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.08 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 		 451 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  decreased coverage  0.0000299289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.17 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.22 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.17 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  30.35 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  30.98 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.33 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>