More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1835 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 563 aa  1155    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 581 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 		 597 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  31.09 
 
 		 585 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.99 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 550 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 566 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 558 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.77 
 
 		 578 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  27.72 
 
 		 591 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 576 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 555 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 555 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 580 aa  137  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  25.19 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 614 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 592 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.59 
 
 		 622 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 569 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 606 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 566 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  26.16 
 
 		 619 aa  118  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  25.35 
 
 		 606 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 		 592 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 622 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 599 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.58 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 		 635 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.3 
 
 		 581 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 622 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 516 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 608 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 624 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 624 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 624 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 600 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  28.84 
 
 		 635 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.25 
 
 		 545 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 516 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 579 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 618 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 519 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 526 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A28  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  23.26 
 
 		 529 aa  87.8  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00880825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 		 507 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.57 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  21.96 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  22.12 
 
 		 533 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.59 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.83 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.83 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 631 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 538 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 610 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 595 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.94 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 629 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>