More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4014 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  79.97 
 
 		 590 aa  918    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 569 aa  1164    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 576 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  27.39 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  32.39 
 
 		 567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 550 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.14 
 
 		 578 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 567 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.89 
 
 		 579 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  26.63 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 565 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.14 
 
 		 545 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  22.72 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 524 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 597 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 567 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.67 
 
 		 622 aa  90.1  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 599 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.48 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.94 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 		 562 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.4 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.46 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  21.76 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.91 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  22.66 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.42 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.24 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  24.44 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.89 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.85 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.41 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.06 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  22.84 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.33 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.15 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  23.27 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>