More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7779 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 597 aa  1213    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  49.17 
 
 		 581 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  31.32 
 
 		 585 aa  242  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 570 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 		 576 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.31 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 567 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.43 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  30.41 
 
 		 619 aa  177  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  29.19 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 554 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  27.11 
 
 		 591 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 550 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 558 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 592 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  27.33 
 
 		 606 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 604 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 600 aa  145  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.15 
 
 		 581 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 606 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 541 aa  133  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 579 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 592 aa  130  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 617 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 635 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 618 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 		 565 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 512 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  25.04 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 569 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 629 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  35.8 
 
 		 635 aa  94  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 599 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 566 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 521 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.95 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 622 aa  89  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.11 
 
 		 521 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 608 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 528 aa  87.8  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 522 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 604 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 514 aa  87  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 526 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.34 
 
 		 622 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 587 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.05 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.25 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.22 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 603 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 532 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.46 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.46 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.46 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.16 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.46 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.26 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.62 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  23.95 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>