More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0761 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 604 aa  1244    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.54 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.63 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 600 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  29.81 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  27.8 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 581 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 592 aa  183  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 635 aa  153  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 570 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.05 
 
 		 567 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.99 
 
 		 585 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  25.64 
 
 		 591 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 592 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 567 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 567 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 558 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.43 
 
 		 579 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  23.82 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  24.47 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 548 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.46 
 
 		 622 aa  93.6  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 548 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  21.38 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 599 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 538 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.61 
 
 		 556 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  23.16 
 
 		 518 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  21.29 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  24.79 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.18 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.96 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  20.09 
 
 		 514 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 526 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  21.52 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  21.21 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  21.06 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  20.83 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  21.9 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.75 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.47 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.1 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.87 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>