121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2585 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  74.95 
 
 		 549 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  74.95 
 
 		 549 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 548 aa  1103    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  74.95 
 
 		 549 aa  787    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  85.04 
 
 		 548 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  65.11 
 
 		 557 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  36.71 
 
 		 555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.51 
 
 		 581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 606 aa  173  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  26.58 
 
 		 606 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 600 aa  153  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  27.36 
 
 		 619 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 592 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 635 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 604 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 592 aa  92  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 581 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.22 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  25.73 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  35.83 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.08 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 570 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.6 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.75 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.75 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.97 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.97 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.97 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.18 
 
 		 578 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  21.15 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.93 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.52 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 541 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 599 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  25.12 
 
 		 635 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  21.09 
 
 		 545 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  21.16 
 
 		 531 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  22.04 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 555 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 555 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  21.52 
 
 		 559 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 557 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 525 aa  51.2  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  22.43 
 
 		 558 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  20.2 
 
 		 555 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 541 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  20.37 
 
 		 566 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  24.39 
 
 		 523 aa  50.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  20.2 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  21.81 
 
 		 552 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  23.93 
 
 		 533 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  19.52 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  20.56 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 529 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.43 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  20.97 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 526 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  21.67 
 
 		 551 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.52 
 
 		 537 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  21.67 
 
 		 551 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 545 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 522 aa  47.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 544 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 624 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 624 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 624 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  20.7 
 
 		 537 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>