216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4539 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  78.12 
 
 		 624 aa  873    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  78.12 
 
 		 624 aa  873    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 608 aa  1199    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  78.12 
 
 		 624 aa  873    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  84.38 
 
 		 599 aa  977    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  72.1 
 
 		 635 aa  820    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  40.3 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  37.38 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.84 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  35.37 
 
 		 566 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  32.98 
 
 		 603 aa  200  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  34.2 
 
 		 570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.52 
 
 		 567 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 567 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 576 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 563 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  23.71 
 
 		 568 aa  97.8  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.99 
 
 		 578 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 579 aa  91.3  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 581 aa  91.3  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 597 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 550 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 555 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 555 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  29.61 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.09 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 580 aa  73.9  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.68 
 
 		 538 aa  67  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  23.77 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.39 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.02 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 538 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  22.29 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.57 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  21.97 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  21.44 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.38 
 
 		 592 aa  57  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 606 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 548 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.34 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 622 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.1 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 526 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 555 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  22.19 
 
 		 581 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  22.65 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 627 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  20.6 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.72 
 
 		 525 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 508 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 556 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 619 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.95 
 
 		 531 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 		 556 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 551 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 511 aa  53.9  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 541 aa  53.9  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 		 522 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 		 556 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.74 
 
 		 528 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  33.96 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 545 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  24.68 
 
 		 543 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 558 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 543 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  24.68 
 
 		 543 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 557 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 543 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.19 
 
 		 545 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>