More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 586 aa  1202    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  35.9 
 
 		 604 aa  324  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  30.11 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 606 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  28.75 
 
 		 606 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 592 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.07 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  26.24 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 581 aa  164  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 611 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 579 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 570 aa  136  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 567 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  27.2 
 
 		 585 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 534 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 580 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 567 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.73 
 
 		 578 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.71 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 639 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.8 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.41 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.18 
 
 		 538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  23.12 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 617 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 569 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 581 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 604 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 565 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 588 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 526 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 580 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 580 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.41 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  24.06 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.8 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.77 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.13 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.09 
 
 		 545 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 576 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 557 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 548 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 532 aa  94.4  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 522 aa  94  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.8 
 
 		 528 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.16 
 
 		 524 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.8 
 
 		 528 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.33 
 
 		 568 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.78 
 
 		 528 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.78 
 
 		 528 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.52 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 565 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.55 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.48 
 
 		 622 aa  88.6  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.31 
 
 		 542 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.86 
 
 		 529 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.41 
 
 		 528 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  22.63 
 
 		 520 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.5 
 
 		 528 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.75 
 
 		 527 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.05 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.09 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>