More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4433 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  86.55 
 
 
558 aa  1000    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  67.15 
 
 
555 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  67.15 
 
 
555 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
550 aa  1118    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  64.53 
 
 
591 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  67.15 
 
 
554 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  39.89 
 
 
570 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.26 
 
 
578 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  37.48 
 
 
567 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  37.31 
 
 
566 aa  342  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  38.04 
 
 
567 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  36.64 
 
 
568 aa  334  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 
576 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  35.23 
 
 
551 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.14 
 
 
579 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 
565 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
580 aa  193  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
592 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
563 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
581 aa  178  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
569 aa  167  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 
590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
597 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  26.78 
 
 
606 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
592 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  25.27 
 
 
619 aa  127  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.53 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
600 aa  120  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
606 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.03 
 
 
622 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 
567 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.05 
 
 
546 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
592 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.95 
 
 
581 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
510 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
603 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
512 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
599 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.82 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
531 aa  84  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
522 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  23.14 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
604 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
608 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
586 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
527 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.49 
 
 
529 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.84 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
576 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 
544 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
524 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.84 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
586 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.08 
 
 
504 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.32 
 
 
532 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.49 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.68 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
508 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
510 aa  77  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
538 aa  77  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
503 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.92 
 
 
503 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
544 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  24.56 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.72 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.09 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.08 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 
622 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 
569 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.04 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.21 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  22.3 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.47 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  26.21 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.15 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.25 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  24.09 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
618 aa  73.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
589 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.97 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>